红薯体积大，如果保管合理能贮藏8个月左右，完好率可达96%以上，保管不好则半个月左右就会发生腐烂。
红薯在贮藏过程的生理变化。
首先是呼吸作用。分为有氧呼吸和缺氧呼吸。有氧呼吸是吸收氧气，把淀粉转化为糖，放出二氧化碳、水和热量。缺氧呼吸也是分解糖分，但所产生的是酒精和二氧化碳，其中酒精对薯块有毒害作用，会降低薯块的生命力，因而发生烂薯。其次是薯块愈伤组织的形成，它与温度和湿度等条件有关。另外在贮藏过程中，水份、淀粉、糖份、果胶质都会发生变化。
红薯贮藏的方式。
1．室内贮藏 可选择严密而温暖的屋子，搭一炉子用于加温，为方便贮藏应在围一个囤子，长度根据屋子大小和贮藏量的多少而定。天气寒冷时，上边再盖一层草帘防寒，并适当生火加温。
2．井窖贮藏 选择地势高、土质坚实、地下水位低的地方，向下挖一井筒，一般直径1米左右，井筒深5～6米。贮藏室的大小可根据贮藏量多少而定。贮藏室内要垫10～15厘米厚的干沙，其上放置甘薯。甘薯只能装七成满，以便留出换气的地方，否则会因湿、热而加重腐烂。
3．棚窖贮藏 一般挖宽约2米，长3～4米，深2米左右的地窖。将甘薯由底向上逐块堆积，应避免甘薯与窖壁直接接触。
4．屋窖贮藏 屋窖的结构与普遍房屋相似，但墙壁屋顶很厚，四周密封，窗户打开，有加温用的火道，可进行高温愈伤处理。屋窖有大屋窖(贮1万～5万千克)和小屋窖两种。小屋窖的窖体小，省工省料，适合农户贮藏用，一般每窖可贮1 500～3 000千克。
薯窑的消毒
在收获前半个有，打开窑门通风，并将窑内的四周和地面的旧土铲下，再用福尔马林0.5公斤加水25公斤喷洒，或用硫磺熏蒸2次。
适时收获及时入窑
气温在10度以上收获完毕，收获时应选择无风晴天，当天收当天入窑，不要让薯块在地里过夜。收时应精收精选。
红薯贮藏的环境要求较高的湿度和严格的温度。高于18度易生芽，低于10度易腐烂。应将温度控制在10-15度，12-13度最好，湿度90-95%最好。一般又可以分为前中后三个时期。前期，为防红薯发芽，以通风、散热、降温为主。中期，入窑后20天到第二年的2月初，应注意保温，以防寒为主。后期，立春到出窑，以稳定窑温，通风换气为主。
